MES制造執行系統在實施過程中其實并不是很順利的，在功能方面，控制方面，制造方面均可能會遇到一些問題，包括生產，訂單跟蹤等方面。那么，MES制造執行系統實施中會遇到哪些問題?

　　MES制造執行系統的前期信息化實施矛盾集中體現

　　企業實施MES制造執行系統的時候前期來源于信息化項目，尤其是公司的ERP系統，在ERP深化應用的過程中，erp并不能很好的對公司各項數據進行統計，比如(如信息及時反饋、質量管理、高級計劃排程等等)。然后就系統通過MES系統實施解決ERP存在的問題，前ERP期等項目應用中矛盾就體現出來，希望MES制造執行系統能解決所有涉及生產管理的問題。

　　MES制造執行系統的準備工作的不足

　　MES需要大量的基礎數據來支持，需要從以前的信息系統中獲取大量的數據。由于準備不足，隨著MES實施的深入，相關問題層出不窮;評價缺失;缺乏合理、科學的MES應用評價體系，其價值難以凸顯，繼續深化應用的薄弱環節。

　　MES制造執行系統龐大，不知道誰先后使用的問題

　　MES是一個龐大的系統，模塊之間的邏輯關系是什么?實施的前提是什么?執行的前提是什么?它非常復雜。然而，MES制造執行系統在功能描述和ERP功能上有很多重疊和交叉，那么MES的真正內涵和外延是什么?如何定義ERP的邊界?如果不深入研究ERP和MES執行系統，就很難定義。

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